Родился 4 сентября 1973 года в Тегеране (Иран). В детстве занимался в театральной студии под руководством Сергея Казарновского, окончил музыкальную школу. 

В 1994 году окончил актёрский факультет Театрального института имени Бориса Щукина (курс Владимира Иванова).

В 1993 году Пирогов исполнил роль Квентина в спектакле «Шум и ярость» по роману Уильяма Фолкнера — совместной постановке студентов ГИТИСа и Щукинского училища под руководством Сергея Женовача. В этой постановке его заметил Пётр Фоменко, и Пирогов стал первым актёром, принятым в труппу «Мастерской Петра Фоменко» «со стороны», не будучи выпускником курса самого режиссёра. 

Некоторые роли Пирогова в театре:

Дебют Пирогова в качестве режиссёра состоялся на сцене «Мастерской Петра Фоменко», где он поставил спектакль «Театральный роман» по Михаилу Булгакову (совместно с Петром Фоменко), за который в 2012 году был удостоен премии «Хрустальная Турандот». 

Пирогов преподаёт на кафедре мастерства актёра в Театральном институте имени Бориса Щукина (доцент), где в 2023 году выпустил свой первый курс в качестве художественного руководителя.